Les biotechnologies: une aide à la sélection variétale

Un marqueur peut être décrit comme un jalon le long des chromosomes. Il permet de positionner précisément les gènes d’intérêt. Pour rappel, les chromosomes sont constitués par les gènes, et le gène est une séquence d’ADN qui porte une information spécifique. Ces marqueurs permettent de gagner du temps lors de la sélection variétale. A titre d’exemple si tous les gènes d’intérêt sont marqués, il est possible d’éliminer tous les individus ne présentant pas ces marqueurs. Ainsi, il n’est plus utile d’attendre que le caractère s’exprime pour sélectionner les individus souhaités. Plus le marqueur est proche du gène d’intérêt, plus la sélection est facilitée. La recherche développe de nouveaux marqueurs de manière à suivre un nombre de gènes de plus en plus grand.

Une autre méthode de sélection consiste à séquencer tout le génome de la plante dans le but d’identifier les parties du génome qui jouent sur un caractère d’intérêt donné. C’est la sélection génomique.

Enfin, la génétique d’association est une nouvelle méthode de sélection qui a pour objectif de travailler sur des cibles comme le rendement, la tolérance à la sécheresse, ou l’utilisation de l’azote. Elles sont beaucoup plus complexes à analyser car elles touchent à la régulation de la plante, à son fonctionnement intrinsèque. Cette méthode de sélection se fonde sur un modèle statistique qui réalise des correspondances entre génotypes et phénotypes, autrement dit pour quelle séquence de gènes donnée nous observons une variété avec un meilleur rendement, une meilleure tolérance à la sécheresse ou aux maladies, ou meilleur coefficient d’utilisation de l’azote. Pour atteindre ce niveau de performance, des centaines de millier de génotypes et de phénotypes doivent être identifiés, et l’outil statistique doit être suffisamment puissant pour permettre de faire la relation.

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